СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ, используемых в биотехнологии
(за основу взят список по Б. Глику, Дж. Пастернаку)
Адаптер. 1. Синтетический двухцепочечный олигонуклеотид с одним тупым концом и одним липким концом. После пришивания адаптера тупым концом к ДНК-мишени последнюю можно встраивать в подходящий вектор, используя приобретенный ею липкий конец. 2. Синтетический одноцепочечный олигонуклеотид, у которого после самогибридизации появляются липкие концы и внутренний сайт для рестрицирующей эндонуклеазы. Когда адаптер встраивают в клонирующий вектор, у вектора появляется новый сайт рестрикции.
Аденин. Пуриновое основание, комплементарное тимину и урацилу. Одно из азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.
Активатор. 1. Вещество, стимулирующее транскрипцию специфического гена и оперона. 2. Белок, связывающийся с опероном и ускоряющий транскрипцию; используется также название «активаторный белок».
Актин. Белок мышечных волокон, входит в состав актомиозина — основного сократительного мышечного белка.
Аллель. Одна из двух (или нескольких) альтернативных структурных форм гена.
Если вас интересует словарь ассоциаций, рекомендуем вам Словарь синонимов русского языка Sinonim.org. Здесь можно найти синонимы для разных слов, также есть словарь антонимов и словарь ассоциаций. При разработке был использован словарь синонимов Тришина В.Н. В словарь постоянно добавляются новые слова.
Аллостерическая регуляция. Регуляция активности фермента, осуществляемая эффекторной молекулой, которая связывается с участком в молекуле фермента, удаленным от активного центра.
Альгинат. Полисахарид, синтезируемый различными водорослями и бактериями; состоит из остатков p-D-маннуроната и a-L-гулуроната.
Альтернативный сплайсинг. Соединение экзонов данного гена в разных комбинациях с образованием различающихся зрелых молекул мРНК.
Аминоацил-тРНК. Молекула тРНК, к 3′-концу которой присоединена специфическая аминокислота.
Аминоацильный сайт, A-сайт. Участок рибосомы, связывающий аминоцил — тРНК в процессе трансляции.
Аминокислота. Мономерная единица («строительный блок») белковых молекул.
Ампликон. Плазмидный вектор вируса простого герпеса типа 1.
Анаэробные микроорганизмы. Микроорганизмы, растущие в отсутствие кислорода.
Антибиотик. Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и оказывающее ингибирующее действие на другие микроорганизмы и раковые клетки.
Антиген. Вещество, воспринимаемое организмом как чужеродное и вызывающее специфический иммунный ответ — выработку антител.
Антикодон. Триплет нуклеотидов в молекуле тРНК, комплементарный нуклеотидам специфического кодона в молекуле мРНК.
Антипараллельная ориентация. Противоположная направленность (5′ → 3′ и 3′ → 5′) цепей в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот.
«Антисмысловая» цепь. 1. Транскрибируемая (кодирующая) цепь в молекуле хромосомной ДНК. 2. Одна из нитей в двухцепочечной молекуле ДНК, нуклеотидная последовательность которой комплементарна таковой у соответствующей мРНК.
Антисыворотка. Жидкая составляющая крови, содержащая антитела.
Антитело. Белок (иммуноглобулин), синтезируемый В-лимфоцитами в ответ на попадание в организм различных антигенов и специфически с ними взаимодействующий.
Антифризный белок. Богатый аланином белок, вырабатываемый в печени некоторых водных организмов и предотвращающий замерзание плазмы крови. Обнаружен также в клетках некоторых насекомых, растений, бактерий, где он регулирует образование кристаллов льда при низких температурах.
Аптамер. Синтетический полинуклеотид, связывающийся с белком, в норме не взаимодействующим с нуклеиновыми кислотами.
Аттенуированная (ослабленная) вакцина. Вакцина, приготовленная с использованием ослабленных тем или иным образом микроорганизмов.
Аутологичные клетки. Клетки, взятые от данного организма, культивированные, возможно, генетически измененные и вновь введенные в организм-донор.
Аутосома. Любая хромосома, не являющаяся половой. В соматических клетках человека присутствуют 22 пары аутосом и одна пара половых хромосом.
Аутосомное наследование. Несцепленное с полом наследование какого-либо признака.
Ацилпереносящий белок. Низкомолекулярный белок, компонент более крупного комплекса, участвующего в биосинтезе жирных кислот или полипетидов.
Аэробные микроорганизмы. Микроорганизмы, растущие только в присутствии кислорода.
Бакмида. Челночный вектор на основе генома AcMNPV, способный существовать в клетках Е. coli и клетках насекомых.
Бактериофаг. Вирус, инфицирующий бактерии.
Бактериоцин. Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и убивающее клетки другого микроорганизма.
Баллистическая трансфекция. Введение ДНК в растительные и животные клетки или органеллы с помощью вольфрамовых или золотых шариков. ДНК осаждают, покрывают ею шарики и «обстреливают» ими клетки.
G-белки. Мембранные белки, активизирующиеся после взаимодействия с GTP. Участвуют в передаче сигнала от клеточных рецепторов к ферментам на внутренней поверхности мембран.
Белки теплового шока. Белки, синтезируемые в ответ на резкое повышение температуры.
Бетаин. Низкомолекулярное соединение, служащее донором метильной группы при биосинтезе метионина.
Библиотека кДНК. Коллекция клонов кДНК, синтезируемых in vitro на матрицах мРНК, происходящих из одной ткани или клеточной популяции.
Бинарная векторная система. Двухплазмидная система Agrobacterium, предназначенная для переноса участка тДНК, несущего клонированные гены в растительные клетки. Гены вирулентности локализованы на одной плазмиде, а встроенный участок тДНК — на другой.
Бинарное деление. Прямое, не связанное с половым процессом разделение прокариотической клетки на примерно одинаковые по размерам дочерние клетки.
Биодеградация. Разрушение загрязняющих веществ, попавших в окружающую среду, с помощью живых микроорганизмов.
Биоконтроль. Процесс, в котором используется живые организмы для ограничения роста и развития патогенных микроорганизмов.
Биомаркер. Биологический признак, позволяющий судить о прогрессировании патологического процесса или об эффективности лечения.
Биомасса. 1. Клеточная масса, образующаяся в результате жизнедеятельноети живых организмов. 2. Органическое вещество, которое может использоваться как источник энергии или химических соединений.
Биореактор, фертешкер. Устройство, к котором протекают биохимические реакции при участии живых микроорганизмов, клеточных экстрактов или ферментов. Часто этот термин относится к сосуду, в котором, растут микроорганизмы.
Блоттинг. Перенос разделенных молекул из одной среди (например, геля) на твердый носитель (бумагу, нетроцеллюлозный фильтр).
Брошь, пробел. Отсутствие одного или нескольких нуклеотидов в одной и цепей двухцепочечной ДНК.
Вакцинация. Введение в организм антигена с тем, чтобы индуцировать в нем выработку антител к возможному инфицирующему агенту.
Вариабельные домены. Участки полипептидных цепей антитела, имеющие неодинаковую аминокислотную последовательность у молекул разных антител, отвечают за специфичность последних.
Вектор. Самореплицирующаяся молекула ДНК (например, бактериальная плазмида), используемая в генной инженерии для переноса генов из организма-донора в организм-реципиент, а также для клонирования нуклеотидных последовательностей.
Вестерн-блоттинг. Перенос белковых молекул, разделенных с помощью гель-электрофореза, на твердую подложку.
Вирион. Вирусная частица.
Вирулентность. Характеристика патогенности микроорганизма.
Вирус-помощник. Вирулентный штамм вируса, в присутствии которого дефектный вирус может размножаться в клетке-хозяине.
Время генерации (удвоения). Время, за которое в популяции одноклеточных организмов удваивается число клеток.
Вставка. Сегмент ДНК, встроенный и клонирующий вектор.
Вторичный метаболит. Вещество, не являющееся обязательным для роста или функционирования клетки, но синтезирующееся в стационарной фазе (обычно участвует в защите клеток или микроорганизмов от тех или иных воздействий).
Гамета. Репродуктивная гаплоидная клетка многоклеточного организма.
Гаплоидный. Термин, характеризующий организм (клетку), у которого имеется один набор хромосом.
Ген. Транскрибируемый участок хромосомы, кодирующий функциональный белок либо тРНК или рРНК.
Ген «самоубийства», «суицидальный» ген. Ген, вызывающий при определенных условиях гибель собственной клетки.
Генетический код. Система записи генетической информации в виде последовательности нуклеотидов, в которой каждые три нуклеотида, составляющие кодон, кодирует одну аминокислоту. Состоит из 64 кодонов, кодирующих все 20 аминокислот и три терминирующих кодона.
Ген-кандидат. Структурный ген в геноме человека, мутация в котором предположительно является причиной конкретного наследственного заболевания.
Ген-мишень. 1.Клонированный ген. 2. Ген, подвергаемый специфическому воздействию. 3. Ген, интересующий исследователя.
Генная иммунизация. Индукция у организма иммунного ответа без введения антигена, путем включения в клетки гена, кодирующего белок-антиген.
Генная терапия ex vivo. Введение гена (или гаков) в изолированные клетки больного. После культивирования и трансформации клетки вводят в организм больного с помощью трансфузии, инфузии или инъекции. Эта процедура позволяет устранять генетические дефекты.
Генная терапия in vivo. Введение гена (генов) непосредственно в ткань или орган с целью устранения генетического нарушения.
Геном. Совокупность генов гаплоидного набора хромосом данного организма.
Геномная библиотека, банк генов. Набор клонированных фрагментов ДНК, в совокупности составляющих индивидуальный (групповой, видовой) геном. Если речь идет о крупном геноме (млекопитающие), то получают хромосомоспецифичные библиотеки.
Генотип. Генетическая конструкция организма, набор всех его аллелей (альтернативных форм).
Гетерозигота. Организм, в геноме которого имеются одна или несколько пар различающихся аллелей.
Гибридный белок, химерный белок. Продукт клонированных совместно двух или более кодирующих последовательностей из разных генов; представляет собой одну полипептидную цепь.
Гибридный ген. Ген, состоящий из частей двух или нескольких, генов и экспрессирующийся как единое целое с образованием гибридного (химерного) белка.
Гибридома. Гибридная клеточная линия, полученная при слиянии нормальных антителообразующих клеток (лимфоцитов) и миеломных клеток, обладает способностью к неограниченному росту и синтезу моноклональных антител.
Гомологичные. Происходящие из одного источника или имеющие сходную структуру или эволюционное происхождение.
Гомомерный белок. Белок, состоящий из двух или более идентичных полипептидных цепей (субъединиц).
Группа несовместимости. Группа плазмид, представители которой могут сосуществовать в одной клетке.
Группа совместимости. Группа плазмид, члены которой не способны сосущестовать в одной бактериальной клетке.
Гуанин. Пуриновое основание, комплементарное цитозину; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.
Гуморальный иммунный ответ. Синтез антител В-клетками иммунной системы в ответ на присутствие в организме чужеродных антител.
Дегалогенирование. Отщепление атома галогена (хлора, иода, брома, фтора), обычно при биодеградации.
Дезоксирибоза. Пятиуглеродный моносахарид, входящий в состав ДНК.
Дезоксирибонуклеаза 1, ДНКаза 1. Фермент, расщепляющий дврхцепочеченую ДНК. Используется для очистки препаратов РНК и бесклеточных экстрактов.
Дезоксирибонуклеиновая кислота, ДНК. Полимер, состоящий из дезоксирибонуклеотидов; видоспецифичный носитель генетической информации.
Делеция. Выпадение участка хромосомы ш ее внутренней области.
Денатурация. 1. Расхождение цепей двухцепочечной молекулы ДНК или РНК. 2. Нарушение ютивной конформаций биологических макромолекул в результате разрушения нековалентных (водородных) связей.
Диплоид. Организм, клетки которого содержат два гомологичных набора хромосом.
Дисульфидная связь. Ковалентная связь между двумя атомами серы, входящими в молекулы цистеина; стабилизирует третичную структуру полипептидных цепей.
Дитиотрейтол. Низкомолекулярный тиолсодержащий восстанавливающий агент. Добавляется в буферные растворы в низкой концентрации для предотвращения окисления сульфгидрильных групп в белках. В высоких концентрациях используется для восстановления дисульфидных связей;
ДНК-зонд. Фрагмент ДНК, меченый тем или иным образом и использующийся для гибридизации со специфическим участком в молекуле ДНК. Позволяет идентифицировать комплементарные нуклеотидные последовательности.
ДНК-лигаза. Фермент, катализирующий образование фосфорнодиэфирной связи между 3′-гидроксильной группой и 5′-фосфатом соседних нуклеотидов в месте одноцепочечного разрыва молекулы ДНК.
ДНК-полимераза. Фермент, катализирующий синтез полинуклеотидной цепи из отдельных нуклеотидов с использованием другой цепи в качестве матрицы и ДНК-затравки со свободной 3′-ОН-группой.
Додецилсульфат натрия. Анионный детергент, использующийся для денатурации белков.
Домен. Участок полипептидной цепи, выполняющий определенную функцию (например, цитоплазматический домен, трансмембранный домен и т.д.)
Емкость вектора. Максимальный размер участка ДНК, который может быть клонирован в данном векторе,
Енолаза. Фермент, катализирующий превращение 2-фосфоглицерата в фосфоенолпируват.
Енолредуктаза. Фермент, участвующий в синтезе поликетидных антибиотиков.
Заместительная терапия. Введение в организм метаболитов, кофакторов, гормонов, восполняющих их дефицит, обусловленный генетическим дефектом.
Зонд. 1. Соединение, меченое тем или иным способом и использующееся для выявления родственных биохимических молекул в сложном образце. 2. Олигонуклеотид, использующийся для выявления комплементарных последовательностей с помощью гибридизации.
Иммунотерапия. Использование антитела или химерного белка, содержащего caйт связывания антитела, для лечения больного или облегчения его состояния.
Иммунный ответ. Совокупность физиологических процессов в организме, индуцируемых при попадании в него чужеродных веществ.
Иммуноаффинная хроматография. Метод очистки, при котором фиксированное на матрице антитело связывает специфический белок, присутствующий в сложной смеси других белков.
Иммунологический. Метод, основанный на способности антитела узнавать специфический компонент в биологическом образце.
Иммуносупрессия. Потеря способности иммунной системы организма к иммунному ответу на тот или иной антиген.
Иммунотоксин. Химерный белок, состоящий из двух доменов, один из которых обладает свойством антитела, другой — токсина. Первый домен обеспечивает связывание химерного белка со специфической молекулой или клеткой, второй инактивирует молекулу-мишень или убивает клетку.
Ингибирование конечным продуктом Ингибирование фермента метаболитом — конечным продуктом метаболического пути.
Индолил-З-уксусная кислота. Растительный гормон, относящийся к классу ауксинов, стимулирующий рост растений.
Индуктор. Небольшая молекула, связывающаяся с регуляторным, белком — репрессором, что приводит к дерепрессии соответствующих генов.
Индукция. Дерепрессия гена или группы генов под действием индуктора
Инициация. Начало синтеза биополимера.
Инициирующий кодон. Сигнал инициации трансляции.
Инициирующий комплекс. Структура, необходимая для инициации синтеза полипептидной цепи рибосомами.
Интеграция. Встраивание чужеродной ДНК (обычно с помощью гомологичной рекомбинации) в хромосому хозяйской клетки.
Интегрирующий вектор. Вектор, специально сконструированный ддя того, чтобы с его помощью можно было встраивать (интегрировать) клонированную ДНК в геном клетки-хозяина.
Интерлейкин-2. Лимфокин, секретируемый некоторыми Т-лимфоцитами и стимулирующий пролиферацию Т-клеток.
Интрон. Транскрибируемый участок гена, не содержащий кодонов и вырезаемый из первичного транскрипта в ходе процессинга с образованием функциональной РНК.
Ионный канал. Трансмембранный белок, облегчающий транспорт определенных ионов.
Исключение. Вырезание сегмента ДНК из хромосомы или клонирующего вектора, осуществляемое in vivo иди in vitro в помощью специфического фермента.
Искусственная бактериальная хромосома. Векторная система на основе F-плазмиды Е. coli, используемая для клонирования длинных последовательностей.
Капсид. Белковая оболочка вирусной частицы.
Картирование генов. Определение положения данного гена на хромосоме относительно других генов.
В-кпетки. Лимфоциты из клеток костного мозга, продуцирующие антитела.
Клеточная линия. Группа клеток, поддерживаемая в культуре путем процессов.
Клеточно-опосредованный (клеточный) иммунитет. Иммунные реакции, инициируемые клетками, а не антигенами или другими гуморальными факторами,
Клон. Популяция клеток или молекул, идентичных одной родоначальной клетке или молекуле.
Клонирование. Совокупность процедур, исполняющихся для получения клонов.
Клонирование генов. Система методов, использующаяся для получения клонированных ДНК; выделение нужного гена из какого-либо организме, встраивание его в плазмиду (вектор), введение в клетку организма-хозяина, многократная репликация.
Клонирующий вектор. Молекула ДНК (плазмидная или вирусная ДНК), предназначенная для клонирования ДНК-мишени.
Кодон. Три соседних нуклеотида, кодирующих определенную аминокислоту. Всего существует 64 сочетания нуклеотидов в кодонах; 61 из них кодирует 20 аминокислот, 3 являются нонсенс-кодонами.
Компетенция. Способность бактериальных клеток воспринимать трансформирующую ДНК (обычно плазмиду).
Комтемент. Белковый комплекс сыворотки крови, один из составляющих врожденного иммунитета. Принимает участие в регуляции воспалительных процессов, активации фагоцитоза и литическом действии на клеточные мембраны; активизируется взаимодействием с иммунным комплексом.
Комплементарная ДНК, кДНК, Молекула ДНК, синтезированная на РНК-матрице с участием РНК-зависимой ДНК-полимеразы (обратной транскриптазы).
Комплементарные нуклеотидные последовательности. Полинуклеотидные последовательности, которые взаимодействуют между собой в соответствии с правилами спаривания оснований: аденин образует пару с тимином (или урацилом), гуанин — с цитозином.
Конститутивный синтез. Постоянно происходящий в клетке или целом организме синтез РНК или какого-либо белка.
Конформационный полиморфизм одноцепочечной ДНК. Различие в конформации одноцепочечных ДНК, отличающихся одна от другой всего одним нуклеотидом. Анализируемые ДНК подвергают денатурации. Денатурированные цепи принимают разную конформаций и при гель-электрофорезе мигрируют с разной скоростью.
Конъюгативные плазмиды. Плазмиды, способные передаваться от одной клетки к другой во время конъюгации.
Конъюгация. Форма полового процесса. У бактерий — однонаправленный перенос ДНК из одной контактирующей клетки в другую.
Кофактор. Низкомолекулярное вещество, необходимое для протекания определенной ферментативной реакции.
Коферментация. Одновременный рост двух микроорганизмов в одном биореакторе.
Ксилоза. Пятиуглеродный сахар, основной компонент гемицеллюлозы.
Культура. Популяция клеток или микроорганизмов, выращиваемых в контролируемых условиях in vitro.
Культуральная среда. Твердая или жидкая среда, использующаяся для выращивания микроорганизмов in vitro.
Лигирование. Соединение двух молекул ДНК с помощью фосфодиэфирных связей; in vitro катализируется ферментом ДНК-лигазой.
Лигноцеллюлоза. Комплекс лигнина, гемицеллюлозы, целлюлозы, составляющий структурный каркас клеточной стенки растений.
Лизис. Разрушение клеточных стенок под действием ферментов, содержащихся в лизосомах, или других агентов.
Линкер. Синтетический олигонуклеотид, содержащий сайт рестрикции. Используется для соединения векторной и клонируемой ДНК, к концам которого по методу сшивания тупых концов присоединены линкеры.
Липаза. Фермент, расщепляющий липиды.
Липние концы. Взаимно комплементарные одноцепочечные участки ДНК, выступающие по концам двухцепочечной молекулы; образуются в резутьтате ступенчатых разрезов двухцепочечных ДНК.
Липополисахарид. Соединение, содержащее липид, связанный с полисахаридом. Один из компонентов клеточной стенки бактерий,
Липосома. Пузырек, образуемый одно- или двухслойной мембраной, состоящей из липидных молекул. Гидрофобная часть этих молекул обращена внутрь пузырька, гидрофильная — наружу. Внутри пузырька могут находиться нуклеиновые кислоты, лекарственные и др. вещества, адресно доставляемые липосомой.
Литический цикл. Размножение вируса в клетке-хозяине, оканчивающееся лизисом клетки.
Локус. Место на хромосоме, где находится специфический ген.
Макрофаг. Крупный лейкоцит, обладающий способность к фагоцитозу
Маркерный ген. Ген с известной хромосомной локализацией, имеющий четкое фенотипическое проявление (устойчивость к антибиотику, ферментативная активность и т.д.).
Маркерный пептид. Участок гибридной белковой молекулы, облегчающий идентификацию или очистку белка.
Матричная РНК, щРНК. Молекула РНК, в которой заключена информация об аминокислотной последовательности определенной белковой молекулы.
Матричная цепь. Цепь ДНК или другой полинуклеотид, используемый ДНК-полимеразой в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи.
Мезофильные микроорганизмы. Организмы, способные расти при температуре от 20 до 50 °С; оптимальная температура роста 37 °С.
Меристема. Ткань растений, обладающая способностью к активному делению. У молодых растений обычно находится у кончиков корней и побегов.
Метаболизм.Совокупность физических и химических процессов, протекающих в организме и обеспечивающих его существование. Продукты метаболизма называются метаболитами.
Метаболическая перегрузка. Нарушение метаболизма организма-хозяина в результате введения в его геном и экспрессии чужеродной ДНК.
Мицелий. Вегетативное тело гриба, состоящее из тонких ветвящихся нитей.
Мишень. В самом широком смысле — биологический объект (ткань, молекула, клетка, микроорганизм), которая интересует исследователя.
Молекулярная диагностика. Выявление молекулярно-биологическими методами патогенного микроорганизма, специфического вещества или измененной нуклеотидной последовательности, ответственных за то или иное заболевание.
Моноклональные антитела. Однотипные антитела, строго специфичные в отношении одного эпитопа (антигенной детерминанты). Синтезируются гибридомами — клеточными гибридами, полученными при слиянии нормальных антителообразующих клеток с миеломной опухолевой клеткой, способной к неограниченному росту. Некоторые миеломные клетки синтезируют моноклональные тела самостоятельно.
Мутагенез. Искусственное ведение мутаций с помощью физических или химических агентов.
Мутант. Организм, измененный в результате мутации, как правило, отличается от исходной формы (дикого типа).
Мутация. Спонтанное или индуцированное изменение структуры гена.
Нарушение комплементарности. Наличие в двухцепочечной молекуле ДНК одной или неекольнких пар некомплементарных оснований.
Неомицинфосфотрансфераза. Фермент, инактивирующий антибиотики неомицин и канамицин; используется как селективный маркер для трансгенных растений.
Непрерывная ферментация. Культивирование микроорганизмов при непрерывном добавлении в биореактор среды и выведении такого же объема суспензии.
Нуклеаза S1. Фермент, специфически деградирующий одноцепочечную ДНК.
Нуклеозид. Пуриновое или пиримидиновое азотистое основание, ковалентно связанное с пятиуглеродным сахаром (пентозой). Если сахаром является рибоза, то вещество называется рибонуклеозид, а если дезоксирибоза ы дезоксирибонуклеозид.
Нуклеотид. Нуклеозид, к которому присоединена одна или более фосфатных групп, присоединение происходит по 5′-углеродному атому сахарного кольца. Нуклеозиды, связанные с рибозой называются рибонуклеозидмонофосфатами, рибонуклеозиддифосфатами или рибонуклеотидтрифосфатами. Для нуклеозидов, связанных с дезоксирибозой, соотвествующие названия таковы: дезоксирибонуклеозидмоно-, ди и трифосфаты.
N-конец. Первая аминокислота (или несколько аминокислот) в белковой молекуле.
Обратная транскриптаза. РНК-зависимая ДНК-полимераза, использующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи ДНК.
Обратная транскрипция — полимеразная цепная реакция. Способ получения в большом количестве кДНК, состоящий из двух этапов. Вначале in vitro синтезируют кДНК, используя обратную транскриптазу, мРНК в качестве матрицы, затем кДНК амплифицируют полимеразной цепной реакцией (ПЦР).
Олигонуклеотид, олигомер. Короткий (6-10 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК, обычно получают химическим путем.
Онкоген. Ген, экспрессия которого приводит к неконтролируемой пролиферации (трансформации) клеток.
Оператор. Участок ДНК, непосредственно примыкающий к структурному гену и регулирующий его транскрипцию при участии репрессора или активатора.
Оперон. Участок ДНК, содержащий несколько структурных генов, травшфйбирутт с образованием одной полицистронной мРНК.
Отжиг. Процесс образования двухцепочечных молекул (ДНК-ДНК или ДНК-РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.
Пассивный иммунитет. Форма иммунитета, возникающая при введений в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате активней иммунизации.
Пептид. Короткая цршчка аминокислот, соединенных пептилными связями.
Пептидил-тРНК. Молекула тРНК с присоединенной к ней растущей полипептидной цепью.
Пептидная вакцина. Короткая цепочка из аминокислот, индуцирующая образование антител к специфическому инфекционному агенту.
Пептидная связь. Ковалентная связь между свободной карбоксильной группой при α-углеродном атоме одной аминокислоты и свободной карбоксильной группой при таком же атоме соседней аминокислоты в полимерной цепи.
Первичная культура. Культура клеток или тканей, взятых непосредственно от организма.
Периодическая ферментация. Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени. Свежую среду инокули- руют посевным материалом И проводят культивирование в непрерывном режиме, не добавляя новых порций среды и не удаляя продуктов, пока процесс не завершится сам собой.
Периодическая ферментация в добавлением субстрата. Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени с периодическим добавлением субстрата и сбором продукта только до завершении процесса.
Периплазматическое пространство.Пространство между плазматической мембраной бактериальной клетки и наружной мембраной или клеточной стенкой.
Перимидины. Один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот, к пиримидинам относятся тимин цитозин, урацил. Второй тип оснований — пурины, к ним относится аденин гуанин.
Плазмида. Внехромосомный генетический элемент, способный к длительному автономному существованию и репликации.
Плазмидная несовместимость. Механизм регуляции числа копий плазмид одного типа в бактериальной клетке. Обеспечивает невозможность внутриклеточного сосуществования плазмид, принадлежащих к одной группе совместимости.
Пластида. Органелла растительных клеток (например, хлоропласт). Многие пластиды имеют собственный геном.
Поливалентная вакцина. Вакцина, дающая иммунный ответ на несколько инфекционных агентов Дли на разные эпитопы одной молекулы.
Поликетидсинтетаза. Фермент, участвующий в биосинтезе поди- кетидных антибиотиков.
Поликетидные антибиотики. Класс антибиотиков, которые образуется в результате последовательной ферментативной конденсации карбоновых кислот (ацетата, пропионата и др.).
Полилинкер. Короткий участок ДНК, содержащий несколько уникальных сайтов узнавания для эндонуклеаз; в эти сайты встраивают чужеродную ДНК (осуществляют клонирование).
Полимеразная цепная реакция (ПЦР). Метод амплификации специфического сегмента ДНК с помощью термостабильной ДНК- полимеразы с использованием олигонуклеотидных ДНК-зондов, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим аплифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии циклически повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов, синтеза ДНК.
Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов. Вариабельность длины фрагментов ДНК, образующихся при ее расщеплении рестриктазами. Обусловлена мутационным изменением сайтов рестрикции или появлением новых сайтов. Обнаруживается при разделении фрагментов с помощью гель-электрофореза.
Полиморфный сайт. Участок хромосомы, представленный в популяции более, чем одним вариантом и встречающийся с частотой не менее 1%.
Полинуклеотид. Линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК.
Полипептид. Линейный полимер, состоящий из аминокислот, соединенных друг с другом пептидными связями. Полипептидом является, например, белковая молекула.
Полицистронная мРНК. Молекула мРНК, кодирующая более одного белка. Образуется при транскрипции двух или более соседних генов, входящих в состав одного оперона.
Посттрансляционные модификации. Изменение структуры белковых молекул после завершения их синтеза рибосомами. К таким модификациям относятся: фосфорилирование, гликозилирование, окисление цистеина, отщепление сигнальных последовательностей и т.д.
Праймер. Короткий олигонуклеотид, который гибридизируется с матрицей и служит затравкой при ее копировании.
Прокариоты. Организмы, у которых нет ограниченных мембранами ядра и органелл. К прокариотам относятся все бактерии.
Промотор. Участок молекулы ДНК, с которым связывается РНК- полимераза, что сопровождается инициацией транскрипции соответствующих генов.
Протеиназы, протеолитические ферменты. Ферменты, расщепляющие пептидные связи в белковых молекулах.
Протеолиз. Ферментативное расщепление белков.
Протопласт. Бактериальная, дрожжевая или растительная клетка, стенка которой разрушена ферментативным или химическим путем.
Процессинг. Совокупность процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке. Включает ряд последовательных расщеплений молекулы-предшественника эндонуклеазой или протеиназами.
Психрофилы. Микроорганизмы, способные расти при температуре 0-5 °С.
Пурины. Один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пуринам относятся аденин и гуанин. Второй тип оснований — пиримидины; к ним относятся тимин, урацил, цитозин.
Реактор с механическим перемешиванием. Биореактор, в котором для равномерного распределения газа по всему объему используются мешалки.
Регуляторный белок. Белок, «включающий» или «выключающий» транскрипцию.
Рекомбинантная ДНК. Молекула ДНК, полученная объединением in vitro разнородных, вместе нигде в природе не существующих фрагментов ДНК.
Рекомбинантная плазмида. Плазмида, измененная; методами генной инженерии. Состоит из участков разных плазмид либо содержит сегменты ДНК других организмов.
Рекомбинантный белок. Белок, кодируемый клонированной рекомбинантной ДНК.
Ренатурация. Воссоединение цепей двухцепочечной ДНК, разошедшихся при денатурации.
Репликация. Процесс самовоспроизведения (синтеза) ДНК.
Репрессия. Один из альтернативных (наряду с индукцией) механизмов регуляции генов. Состоит в подавлении транскрипции трансляции путем связывания белка-репрессора.с опероном.
Репрессор. Белок, связывающийся с оператором или промотором данного гена и блокирующий связывание с этими элементами ДНК- полимеразы.
Рестриктаза, рестрицирующая эндонуклеаза. Бактериальный фермент, расщепляющий двухцепочечную молекулу ДНК в специфических сайтах.
Рестрикционная карта. Диаграмма расположения на молекуле ДНК сайтов узнавания рестриктазами.
Ретровирусы. Группа РНК-содержащих вирусов, содержащих обратную транскриптазу; синтезированная на РНК-матрице двухцепочечная ДНК может встраиваться в хромосому инфицированной этим вирусом клетки.
Рибоза. Пятиуглеродный моносахарид; входит в состав РНК.
Рибозим. Молекула РНК, обладающая ферментативной активностью.
Рибонуклеиновая кислота, РНК. Нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пиримидинов — урацил (вместо тимина).
Рибосома. Клеточная органелла, рибонуклеопротеидная частица, при участии которой осуществляется синтез белка (трансляция). Состоит из двух субчастиц, большой и малой.
Рибосомная РНК, рРНК. РНК, входящая в состав рибосом.
РНК-полимераза. Фермент, осуществляющий синтез РНК из рибонуклеозидтрифосфатов. Матрицей может служить ДНК или РНК, соответствующие РНК-полимеразы называют ДНК- и РНК-зависимыми.
Сайт встраивания (клонирования). Специфический участок векторной молекулы, в который встраивают фрагмент чужеродной ДНК.
Сайт рестрикции. Нуклеотидная последовательность в молекуле ДНК, узнаваемая рестриктазой.
Самореплицирующийся элемент. Внехромосомная молекула нуклеиновой кислоты, способная к независимой от хромосомной ДНК-репликации. Примером такого же элемента служит плазмида.
Секвенирующий гель. Длинная пластина полиэламидного геля, позволяющая проводить электрофоретическое разделение олиго- и полинуклеотидов, различающихся по длине всего на 1 нуклеотид.
Секреция. Выведение веществ из клетки во внешнюю среду.
Сигма-фактор. Бактериальный белок, обеспечивающий узнавание ДНК-полимеразой ее участка связывания в молекуле ДНК и инициацию транскрипции.
Сигнальная последовательность. Нуклеотидная последовательность в гене, служащая местом связывания белка (фактора транскрипции), который регулирует транскрипцию.
Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид. N-концевой участок белковой молекулы длиной 15-30 аминокислот, обеспечивающий секрецию белка. После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы.
Симбиоз. Сосуществование разных организмов, при котором каждый из них выполняет свои функции, в некоторых случаях, взаимовыгодно.
Система комплемента. Серия последовательных процессов активации комплемента (сложного белкового комплекса сыворотки крови) и ферментативных реакций, запускаемая в ответ на образование комплекса антиген-антитело.
Соматическая клетка. Любая неполовая клетка многоклеточного организма,
Сплайсинг. Вырезание из предшественника мРНК интронов и ковалентное соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.
Стационарное состояние. Состояние непрерывного процесса ферментации, при котором число клеток, удаляемых из ферментера и поступающих в него одинаково.
Стволовые клетки. Митотически активные стволовые клетки, в результате деления которых в многоклеточном организме происходит замещение погибших клеток в многоклеточном организме.
Структурный ген. Ген, кодирующий какой-либо белок.
Ступенчатый разрыв. Разрезание двухцепочковой ДНК, при котром разрывы в комплементарных цепях располагаются не строго один напротив другого, а немного смещены.
Субклонирование. Перенос части уже клонированной молекулы ДНК в другой клонирующий вектор.
Субстрат. Вещество, превращение которого катализируется специфическим ферментом.
Субъединичная вакцина. Вакцина, содержащая лишь отдельные компоненты патогенного микроорганизма.
Супрессия. Восстановление утраченной генетической функций, обусловленное подавлением эффекта одной мутации под действием второй.
Тандемный повтор. Нуклеотидная последовательность, состоящая из нескольких одинаковых элементов, соединенных «голова к хвосту».
Терминация. Остановка синтеза макромолекулы.
Терминирующий кодон Кодон, определяющий окончание (терминацию) синтеза полинуклеотидной цепи.
Тимин. Пиримидиновое основание, одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК.
Тканевой активатор плазминогена. Белок, участвующий в разрушении сгустков крови.
Т-клетки. Лимфоциты, играющие ключевую роль в иммунном ответе.
Тн-лимфоциты. Т-хелперы. Т-лимфоциты, играющие основную роль в узнавании чужеродного антигена.
Трансгенный организм. Организм, геном которого содержит чужеродный генетический материал, включенный методами генной инженерии.
Трансгеноз. Введение чужеродного гена в растительную или животную клетку и его передача в ряду поколений.
Транскрипция. Процесс синтеза РНК, катализируемый РНК- полимеразой, в котором в качестве матрицы используется одна из цепей ДНК.
Транслокация. 1. Хромосомная перестройка, заключающаяся к переносе участка хромосомы в новое положение на той же или на другой хромосоме или в переносе целой хромосомы, на другую хромосому. 2.Перемещение молекулы мРНК вo время трансляции на один кодон.
Трансляция. Синтез полипентидной цепи рибосомой с использованием вкачестве матрицы мРНК.
Транпозаза. Фермент, участвующий в транспозиции (перемещении из одного сайта в другой) некоторых мобильных генетических элементов.
Транспортная РНК, тРНК. Молекула РНК, выступающая в роли адаптора при специфическом переносе аминокислот к растущей полипептидной цепи в процессе трансляции.
Трансфекция. Искусственное введение в эукариотические клетки изолированных молекул ДНК.
Трансформация. 1. Перенос генетической информации в бактериальные клетки с участием плазмид или без них, но всегда — без участия вирусов. 2. Превращение нормальных клеток животных вопухолевые.
Тупой конец. Конец двухцепочечной молекулы ДНК, у которого не выступает ни одна из цепей.
Урацил. Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав РНК.
Устойчивые клеточные линии. Культуры клеток, способные к неограниченному росту invitro. Получаются из перевиваемых клеточных культур, честь клеток которых приобретают селективные преимущества и обладают повышенной скоростью роста.
Фактор транскрипции. Белок, помогающий РНК-полимеразе пройти все этапы транскрипции и обеспечивающий избирательность этого процесса.
Фенотип. Совокупность всех признаков особи, формирующаяся в процессе взаимодействия ее генотипа и внешней среды.
Ферментация. В промышленной микробиологи и крупномасштабное культивирование микроорганизмов в специальных емкостях (ферментерах, биорсакторах).
Хромосома. Структура, основу которой составляет конденсированная молекула ДНК, носитель генетической информации. Хромосома способна к воспроизведению с сохранением структурно-функциональной индивидуальности в ряду поколений. У эукариот находится в ядре клетки, у прокариот — непосредственно в цитоплазме.
Хромосомный сайт интеграции. Место в хромосоме, куда может встроиться чужеродная ДНК, часто без всяких последствий для организма-хозяина.
Центрифугирование в градиенте плотности сахарозы. Метод разделения макромолекул по форме и размеру, основанный на различии их коэффициентов седиментации.
Цитозин. Одно из четырех азотистых оснований, входящее в состав ДНК и РНК.
Цитокинины. Растительные гормоны, индуцирующие деление клетки
Частота трансформации. Доля клеток в клеточной популяции, получивших чужеродную ДНК; выражается числом трансформантов к общему числу клеток.
Челночный вектор Плазмидная ДНК, способная реплицироваться в клетках двух разных типов (например, E.coli и клетках дрожжей).
Штамм. Культура генетически однородных микроорганизмов.
Экзогенная ДНК. ДНК, выделенная из организма-донора и встроенная в вектор или хромосомную ДНК организма-хозяина; называется также чужеродной и гетерологичной ДНК.
Экзон. Участок гена, входящий в состав первичного транскрипта, который остается в нем после процессинга (вырезание интронов). Вместе с другими экзонами образует зрелую мРНК.
Экспрессирующий вектор. Плазмидный вектор, сконструированный таким образом, чтобы клонированный ген экспрессировался только в определенной фазе клеточного цикла и только в течение определенного времени. Для этого в плазмиду встраивают сильный регулируемый промотор.
Экспрессия. Транскрипция и трансляция гена.
Электропорация. Образование пор в клеточных мембранах под действием электрического тока. Через эти поры в клетки проникает чужеродная ДНК.
Электрофорез. Метод разделения заряженных молекул (ДНК, РНК или белков), основанный на разной скорости, их перемещения в электрическом поле.
Элонгация. Последовательное присоединение мономеров к полимерной цепи.
Эндонуклеаза. Фермент, гидролизующий внутренние фосфодиэфирные связи и расщепляющий молекулы ДНК и РНК. Эндонуклеазы участвуют в рекомбинации, репарации и рестрикции; в последнем случае называются рестриктазами (рестрицирующими эндонуклеазами).
Эндотоксин. Токсин, не выделяемый клеткой в окружающую среду, а входящий в состав клеточной стенки; многие эндотоксины вырабатываются грамотрицательными бактериямий вызывают воспаление.
Эрлифтный биореактор. Цилиндрический биореактор, в котором перемешивание осуществляется потоком газа, подаваемого снизу.
Эукариоты. Организмы, у которых: 1) имеется ядро, где содержатся хромосомы; 2) в цитоплазме присутствуют различные органеллы — митохондрии, хлоропласты и т.д. К эукариотам относятся животные, растения, грибы, некоторые водоросли.
«Эффект свидетеля». Уничтожение немодифицированных опухолевых клеток цитотоксичным продуктом, синтезируемым соседними генетически трансформированными клетками.
Эффектор. Небольшая молекула, связывающаяся с репрессором или ферментом и приводящая к их ингибированию или активации.
Эффекторные клетки. Клетки иммунной системы, разрушающие антигены.